El Departamento de Meteorología mantiene vínculos de cooperación con distintas instituciones a nivel nacional e internacional, entre las que destacan:
- Dirección Meteorológica de Chile (http://www.meteochile.cl)
- Servicio Meteorológico de la Armada de Chile (http://meteoarmada.directemar.cl/)
- Departamento de Geofísica de la Universidad de Chile (http://www.dgf.uchile.cl/)
- Instituto de Fomento Pesquero (http://www.ifop.cl/)
- Centro de Ciencias de la Atmósfera, Universidad Nacional Autónoma de México, México (http://www.atmosfera.unam.mx/)
- Instituto de Astronomía, Geofísica y Ciencias Atmosféricas, Universidad de Sao Paulo, Brasil (http://iag.usp.br/)